Ubuntu 12.10でibus-skkが学習してくれません。登録モードに入って登録はできるんだけど、再起動すると忘れてちゃいます。
ちょっと調べたら原因は単純でした。
ibus-skkはdefaultで ~/.config/ibus-skk/user.dict をユーザー辞書として使いますが、install直後に ~/.config/ibus-skkというdirectoryが存在していませんでした。
% mkdir ibus-skk
% touch ibus-skk/user.dict
したところ、辞書登録されるようになりました。